Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC11A1P49279 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC11A1P49279 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms