Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMTP48728 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMTP48728 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMTP48728 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMTP48728 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMTP48728 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMTP48728 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms