Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTDSS1P48651 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS1P48651 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms