Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4P46934 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4P46934 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms