Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDKN1BP46527 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms