Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RANGAP1P46060 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
RANGAP1P46060 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RANGAP1P46060 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms