Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms