Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFMP43652 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AFMP43652 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AFMP43652 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AFMP43652 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AFMP43652 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AFMP43652 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AFMP43652 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms