Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTTP42858 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTTP42858 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTTP42858 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HTTP42858 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HTTP42858 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTTP42858 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTTP42858 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTTP42858 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTTP42858 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTTP42858 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTTP42858 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms