Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CASP2P42575 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP2P42575 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP2P42575 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CASP2P42575 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP2P42575 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms