Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YER189WYER189W 369 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 CWC23YGL128C 852 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 PCL5YHR071W 690 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 AIM19YIL087C 474 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YAL064WYAL064W 285 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SFG1YOR315W 1041 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 AME1YBR211C 975 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 GUP1YGL084C 1683 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RRP12YPL012W 3687 nt2.18□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 NPR1YNL183C 2373 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 BAS1YKR099W 2436 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 MIC19YFR011C 513 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 PRE4YFR050C 801 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YGL230CYGL230C 444 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 FSH1YHR049W 732 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 BMT5YIL096C 1011 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 GIM5YML094W 492 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SIP18YMR175W 240 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 UBX3YDL091C 1368 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 PCK1YKR097W 1650 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RAV1YJR033C 4074 nt2.17□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YEL043WYEL043W 2871 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 ESC2YDR363W 1371 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 HSE1YHL002W 1359 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 snR78snR78 87 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YDR203WYDR203W 318 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SDC1YDR469W 528 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 SUI2YJR007W 915 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YLR255CYLR255C 354 nt2.16□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RGA1YOR127W 3024 nt2.15□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 RAD18YCR066W 1464 nt2.15□□□□□ -2.06
SHQ1P40486 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YCR090CYCR090C 549 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YDL118WYDL118W 381 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 THG1YGR024C 714 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 EST3YIL009C-A 546 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YPT52YKR014C 705 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 SMD2YLR275W 333 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YBR062CYBR062C 543 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 CIN2YPL241C 807 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 CUR1YPR158W 759 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 GPI17YDR434W 1605 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 SNU114YKL173W 3027 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.15□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 SET2YJL168C 2202 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 CBF2YGR140W 2871 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 MES1YGR264C 2256 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 PEX8YGR077C 1770 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 NSE4YDL105W 1209 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 ADK1YDR226W 669 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 GPI19YDR437W 423 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YBL012CYBL012C 402 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 LST4YKL176C 2487 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 FAB1YFR019W 6837 nt2.14□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YEA4YEL004W 1029 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 ACB1YGR037C 264 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 CKA1YIL035C 1119 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YAL066WYAL066W 309 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 RPS17AYML024W 411 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 PAI3YMR174C 207 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 PEP12YOR036W 867 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YCL007CYCL007C 393 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 TRZ1YKR079C 2517 nt2.13□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 UBP16YPL072W 1500 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 MFB1YDR219C 1398 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 UBC13YDR092W 462 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 STE2YFL026W 1296 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 RSM27YGR215W 333 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YLR366WYLR366W 306 nt2.12□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YMR045CYMR045C 5268 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YIL166CYIL166C 1629 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 DAL5YJR152W 1632 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 FKS1YLR342W 5631 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 GLC7YER133W 939 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 IGO1YNL157W 507 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 RXT2YBR095C 1293 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 SIR4YDR227W 4077 nt2.11□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 ELG1YOR144C 2376 nt2.1□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 DAD4YDR320C-A 219 nt2.1□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YNL226WYNL226W 411 nt2.1□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt2.1□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 MUD1YBR119W 897 nt2.1□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 MSL5YLR116W 1431 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 SHS1YDL225W 1656 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YCR013CYCR013C 648 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 RPS17BYDR447C 411 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 RMP1YLR145W 606 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YLR224WYLR224W 1110 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 YBR051WYBR051W 351 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 IST2YBR086C 2841 nt2.09□□□□□ -2.07
SHQ1P40486 COS111YBR203W 2775 nt2.09□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 ATP16YDL004W 483 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 NTF2YER009W 378 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 RRF1YHR038W 693 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 COX8YLR395C 237 nt2.08□□□□□ -2.08
SHQ1P40486 RPS16AYMR143W 432 nt2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.6 ms