Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX3P40426 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX3P40426 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PBX3P40426 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms