Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX2P40425 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX2P40425 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX2P40425 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PBX2P40425 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PBX2P40425 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PBX2P40425 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PBX2P40425 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms