Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PBX1P40424 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PBX1P40424 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PBX1P40424 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PBX1P40424 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms