Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THPOP40225 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THPOP40225 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THPOP40225 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THPOP40225 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THPOP40225 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THPOP40225 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THPOP40225 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
THPOP40225 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THPOP40225 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THPOP40225 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THPOP40225 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms