Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	JIP3	YLR331C	378 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	LDS2	YOL047C	1071 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YOR225W	YOR225W	330 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	TIM18	YOR297C	579 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	snR42	snR42	351 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	MES1	YGR264C	2256 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SEC6	YIL068C	2418 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	ATG21	YPL100W	1491 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	FAP7	YDL166C	594 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	PSF1	YDR013W	627 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	ATP17	YDR377W	306 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	ERG28	YER044C	447 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	FMP10	YER182W	735 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	RAD6	YGL058W	519 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YHR063W-A	YHR063W-A	336 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YIL012W	YIL012W	342 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YNL337W	YNL337W	255 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YPL276W	YPL276W	438 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	snR36	snR36	182 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YCR018C-A	YCR018C-A	255 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SMT3	YDR510W	306 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	AIM11	YER093C-A	414 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YKL183C-A	YKL183C-A	213 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	JJJ2	YJL162C	1752 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	UBP5	YER144C	2418 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	POL1	YNL102W	4407 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SMI1	YGR229C	1518 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	GPI8	YDR331W	1236 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	RPL29	YFR032C-A	180 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	NOP19	YGR251W	591 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	PET191	YJR034W	327 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	URA10	YMR271C	684 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SLM6	YBR266C	453 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YKL100C	YKL100C	1764 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	ATP22	YDR350C	2055 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	EMC1	YCL045C	2283 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	STE5	YDR103W	2754 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	MET10	YFR030W	3108 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SPT16	YGL207W	3108 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YGR107W	YGR107W	450 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	RPL39	YJL189W	156 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	RPL15A	YLR029C	615 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	RPL37A	YLR185W	267 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	TVP18	YMR071C	504 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YSW1	YBR148W	1830 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	STE23	YLR389C	3084 nt		3.28	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	PDS5	YMR076C	3834 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SPT4	YGR063C	309 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	RPS7B	YNL096C	573 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SLP1	YOR154W	1764 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	MUS81	YDR386W	1899 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	STE6	YKL209C	3873 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	FRQ1	YDR373W	573 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YJR023C	YJR023C	402 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YKL111C	YKL111C	336 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YLR031W	YLR031W	561 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	HHF1	YBR009C	312 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	APL4	YPR029C	2499 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SPC72	YAL047C	1869 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	IRC4	YDR540C	540 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	GCN4	YEL009C	846 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	NTO1	YPR031W	2247 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	RPL1B	YGL135W	654 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	RPC10	YHR143W-A	213 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	tW(UCA)Q	tW(UCA)Q	74 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	MSL1	YIR009W	336 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YJL202C	YJL202C	348 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	JLP2	YMR132C	627 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	GIS2	YNL255C	462 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	RPB11	YOL005C	363 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	RPL1A	YPL220W	654 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SNX41	YDR425W	1878 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SHE2	YKL130C	741 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	PAU23	YLR037C	375 nt		3.23	□□□□□ -1.89
YBR053C	P38235	SSN8	YNL025C	972 nt		3.23	□□□□□ -1.89

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