Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPARGP37231 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PPARGP37231 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PPARGP37231 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARGP37231 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARGP37231 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARGP37231 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PPARGP37231 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PPARGP37231 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PPARGP37231 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PPARGP37231 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PPARGP37231 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PPARGP37231 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms