Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJC1P36383 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJC1P36383 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJC1P36383 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms