Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT2P35908 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT2P35908 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT2P35908 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT2P35908 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT2P35908 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT2P35908 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms