Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT9P35527 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KRT9P35527 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT9P35527 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT9P35527 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT9P35527 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT9P35527 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms