Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RDXP35241 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RDXP35241 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RDXP35241 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RDXP35241 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RDXP35241 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDXP35241 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RDXP35241 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms