Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM5P33992 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM5P33992 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM5P33992 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM5P33992 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM5P33992 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM5P33992 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM5P33992 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM5P33992 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms