Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	MTC4	YBR255W	2085 nt		3.69	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	KIN4	YOR233W	2403 nt		3.69	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.68	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	RPO31	YOR116C	4383 nt		3.68	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	YBL108W	YBL108W	306 nt		3.68	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	JEN1	YKL217W	1851 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	GPI8	YDR331W	1236 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	YGR107W	YGR107W	450 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	SET1	YHR119W	3243 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.67	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	ELM1	YKL048C	1923 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	MRH1	YDR033W	963 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	IES6	YEL044W	501 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	MRP8	YKL142W	660 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	TIR2	YOR010C	756 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	BIL1	YOR304C-A	231 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	BIT61	YJL058C	1632 nt		3.66	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	SNX41	YDR425W	1878 nt		3.65	□□□□□ -1.82
LYP1	P32487	YER107W-A	YER107W-A	321 nt		3.65	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	RPL19B	YBL027W	570 nt		3.65	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	CWH43	YCR017C	2862 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	MSH2	YOL090W	2895 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YDR102C	YDR102C	333 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YGR051C	YGR051C	324 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YPL238C	YPL238C	390 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.64	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	tC(GCA)B	tC(GCA)B	72 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	tC(GCA)G	tC(GCA)G	72 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	tC(GCA)P1	tC(GCA)P1	72 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	tC(GCA)P2	tC(GCA)P2	72 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YAR029W	YAR029W	225 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	PRE8	YML092C	753 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	TIM18	YOR297C	579 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	TIM12	YBR091C	330 nt		3.63	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	OST1	YJL002C	1431 nt		3.62	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	HMRA2	YCR096C	360 nt		3.62	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YPR014C	YPR014C	330 nt		3.62	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	snR191	snR191	274 nt		3.62	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.62	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	TFB1	YDR311W	1929 nt		3.62	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	USA1	YML029W	2517 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	snR8	snR8	190 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YFL032W	YFL032W	321 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	COX23	YHR116W	456 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	BAT1	YHR208W	1182 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	NDD1	YOR372C	1665 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.61	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YNR065C	YNR065C	3351 nt		3.6	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	VPS3	YDR495C	3036 nt		3.6	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	URM1	YIL008W	300 nt		3.6	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YKL162C-A	YKL162C-A	153 nt		3.6	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.6	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	YHL006W-A	YHL006W-A	354 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	tT(UGU)Q1	tT(UGU)Q1	76 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	MSL1	YIR009W	336 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	TIM8	YJR135W-A	264 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	ROX1	YPR065W	1107 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	SWD3	YBR175W	948 nt		3.59	□□□□□ -1.83
LYP1	P32487	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.59	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	MYO5	YMR109W	3660 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	APC11	YDL008W	498 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	HPA3	YEL066W	540 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	RPL39	YJL189W	156 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	YJL202C	YJL202C	348 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	MCM22	YJR135C	720 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	snR36	snR36	182 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	ARO80	YDR421W	2853 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	CHD1	YER164W	4407 nt		3.58	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	SSY1	YDR160W	2559 nt		3.57	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	EGD1	YPL037C	474 nt		3.57	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		3.57	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	STE5	YDR103W	2754 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	YDR193W	YDR193W	399 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	YDR250C	YDR250C	276 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	AIM32	YML050W	936 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	SIP3	YNL257C	3690 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	ATG26	YLR189C	3597 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.56	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.55	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	PAU14	YIL176C	363 nt		3.55	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	PAU1	YJL223C	363 nt		3.55	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	SHE2	YKL130C	741 nt		3.55	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	RPS22B	YLR367W	393 nt		3.55	□□□□□ -1.84
LYP1	P32487	SSN8	YNL025C	972 nt		3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.2 ms