Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCKARP32238 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCKARP32238 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCKARP32238 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCKARP32238 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCKARP32238 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 566.7 ms