Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXC13P31276 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC13P31276 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC13P31276 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC13P31276 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC13P31276 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC13P31276 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXC13P31276 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXC13P31276 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXC13P31276 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms