Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA11P31270 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA11P31270 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms