Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CRABP1P29762 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CRABP1P29762 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms