Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCSK1P29120 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCSK1P29120 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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