Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMBRP28336 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMBRP28336 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NMBRP28336 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NMBRP28336 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMBRP28336 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMBRP28336 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMBRP28336 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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