Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PLNP26678 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PLNP26678 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PLNP26678 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PLNP26678 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PLNP26678 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms