Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSSP25774 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSSP25774 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTSSP25774 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTSSP25774 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTSSP25774 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTSSP25774 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSSP25774 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSSP25774 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms