Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NR2F2P24468 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR2F2P24468 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms