Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP2B4P23634 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B4P23634 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms