Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRDP23468 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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