Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FGFR3P22607 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGFR3P22607 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms