Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYT1P21579 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYT1P21579 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT1P21579 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT1P21579 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT1P21579 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT1P21579 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYT1P21579 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT1P21579 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT1P21579 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT1P21579 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SYT1P21579 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SYT1P21579 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SYT1P21579 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms