Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDK11BP21127 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDK11BP21127 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms