Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA5P20719 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA5P20719 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms