Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD58P19256 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD58P19256 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD58P19256 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD58P19256 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD58P19256 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD58P19256 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD58P19256 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms