Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCC1P18754 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RCC1P18754 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RCC1P18754 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCC1P18754 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCC1P18754 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCC1P18754 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCC1P18754 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCC1P18754 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RCC1P18754 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RCC1P18754 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RCC1P18754 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RCC1P18754 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCC1P18754 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCC1P18754 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCC1P18754 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCC1P18754 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RCC1P18754 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms