Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DESP17661 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DESP17661 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DESP17661 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DESP17661 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DESP17661 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DESP17661 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DESP17661 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DESP17661 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DESP17661 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms