Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VAV1P15498 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VAV1P15498 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VAV1P15498 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VAV1P15498 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VAV1P15498 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VAV1P15498 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms