Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2F2P13984 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms