Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAR2AP13861 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAR2AP13861 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms