Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ODC1P11926 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ODC1P11926 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ODC1P11926 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ODC1P11926 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ODC1P11926 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ODC1P11926 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ODC1P11926 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ODC1P11926 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ODC1P11926 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms