Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD28P10747 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD28P10747 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD28P10747 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD28P10747 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD28P10747 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CD28P10747 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CD28P10747 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms