Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXB7P09629 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXB7P09629 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms