Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MSMBP08118 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MSMBP08118 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSMBP08118 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSMBP08118 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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