Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN3P07498 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN3P07498 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN3P07498 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN3P07498 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN3P07498 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSN3P07498 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSN3P07498 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms