Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOSP01100 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSP01100 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSP01100 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSP01100 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOSP01100 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOSP01100 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOSP01100 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSP01100 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSP01100 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSP01100 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSP01100 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSP01100 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSP01100 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSP01100 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSP01100 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSP01100 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms